网络数据可视化与分析利器：Gephi 中文教程（全彩） - (EPUB全文下载)

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网络数据可视化与分析利器：Gephi 中文教程（全彩）
第1章 Gephi简介
第2章 Gephi的安装
第3章 Gephi的界面与编辑工具
第4章 图窗体的编辑工具和设置工具
第5章 数据
第6章 外观
第7章 布局
第8章 过滤
第9章 统计
第10章 Gephi的预览界面
第11章 Gephi的颜色选取工具
第12章 Gephi空间坐标
第13章 CSV与Gephi
第14章 动态图
第15章 Gephi的插件管理
第16章 Gephi编程
附录A 代码
附录B 为Gephi提供算法基础的论文
第1章 Gephi简介
本章介绍Gephi的基本情况，包括Gephi是做什么的，着重解释“网络”与“分析”这两个词在Gephi中的含义，同时介绍Gephi的特性及Gephi开发简史。
1.1 Gephi是做什么的
如果用一句话定义Gephi，也许可以定义为：“Gephi是一款用于网络分析的软件”，这句话看起来很简单，但应该如何理解？下面试着从“网络”与“分析”两个关键词做出一个解释说明。
1.1.1 Gephi分析怎样的“网络”
在现在的网络年代，各式各样的网络层出不穷，相信大多数人对于网络都有着不同程度的认识与理解。而Gephi所能处理的网络，应该说与人们所理解的网络基本符合。人们已经具有或者能够想象到的任何网络基本上都可以用Gephi进行处理。
Gephi在处理网络时，需要把网络转换为节点与边这样一种简化的形式。这种用节点与边表示一组事物之间关系的方式，来源于图论。1736年，瑞士数学家欧拉（Leonhard Euler）在他的一篇论文中讨论了Knigsberg（七桥问题），由此产生了一个全新的数学分支——图论（Graph Theory）。
Gephi还提供网络三维与四维的支持，即不仅可以建立三维结构的网络，还可以建立节点与边具有生命期的四维网络，而这种动态网络，以及Gephi内置的一些对网络研究的模块也为时下正引领多学科拓展的新兴学科——网络科学，提供了研究的基础。
一般认为图论也是网络科学的起源。到1936年之前，图论在创立后的200年间一直处于停滞状态，直到1960年数学家Erdos与Renyi发布ER（Erdos-Renyi）随机算法才开始复兴。随后，社会发现小世界的六度空间现象，激发了人们对网络结构的兴趣，物理学家们也加入进来。1999年巴拉巴西（Albert-László Barabási）与他的学生发现无尺度网络现象并揭示出：“真实网络由两个定律支配着，生长机制和偏好连接”，且在多个领域的网络证实。
以上对于网络发展进程的描述，也是对Gephi所研究的“网络”是什么样的一个说明，接下来将介绍Gephi对于这些网络可以提供什么样的“分析”。
1.1.2 Gephi怎样“分析”网络
Gehpi提供的分析可以分为两种，一种是通过不同的布局算法（操作方法详见第7章）按照一定的方式排列节点在图中的位置，并从节点的位置对网络做出解读，也就是直接把关系转换为图，并以图形的方式研究网络；另一种是通过不同的统计算法（操作方法详见第9章）根据节点与边的不同连接关系，用不同方式进行计算，计算的内容包括网络的总体特征、网络的模块化、节点的中心度、节点的路径特征、节点的动态度等。这些统计得出的值会存储到节点或边的数据中，并在外观（操作方法详见第6章）中作用于节点与边，最终也是显示在图形上，供研究发现网络的特性。
Gephi就是通过以上两种方式进行网络的分析，并且在新的Gephi 0.9.0与Gephi 0.9.1版本中，也把动态网络支持作为数据的标准配置，再考虑Gephi本身的开放性，这样的支持，也会为动态网络研究插件的开发留下更多的机会。
可以这样区别Gephi与图论、网络科学三者的关系：网络科学继承了图论中对于图的定义，使用相同的概念与术语，也有部分相同的研究内容；Gephi也继承了图论中对于图的定义，使用相同的概念与术语，也有部分相同的研究内容，且包括网络科学中对于网络研究的模式与方法。Gephi主要用于网络分析。
1.2 Gephi基本情况
1.2.1 Gephi特性
• 基于Java开发。
• 开源、免费。
• 多平台支持，支持Mac OS X、Windows、Linux这3种不同的操作系统。
• 多国语言支持，目前支持英语、法语、西班牙语、日语、葡萄牙语（巴西）、俄语、中文简体、捷克语、德语共9种语言。
• 采用开放协议发布，Gephi支持开放的CDDL 1.0[1.1]与GPLv3[1.2]双重版权协议发布。
1.2.2 Gephi开发简史
• 2006年，法国巴黎政治学院的教师Mathieu Jacomy开发出了Gephi的前身 Graphiltre。
• 2007年9月，Graphiltre更名为Gephi 0.5发布。
• 2008年9月2日，推出Gephi 0.6 Beta。
• 2009年3月1日，Gephi 0.6 Beta 2发布。同年创建GEXF规范，建立Gexf.net。
• 2010年10月1日，Gephi联盟成立，Gephi从此由Gephi联盟运营维护，且推出Gephi 0.7 Beta。
• 2011年10月17日，推出Gephi 0.8。
• 2012年3月29日，推出Gephi 0.8.1。
• 2013年1月3日，推出Gephi 0.8.2。
• 2015年12月20日，重写核心代码，推出Gephi 0.9.0。
• 2016年2月15日，推出Gephi 0.91。
1.2.3 Gephi的基本链接
• Gephi官方网站：https：//gephi.org/。
• 旧应用商店（Gephi 0.9.0版本之前的插件）：https：//marketplace.gephi.org/。
• 新应用商店（Gephi 0.9.0版本之后的插件）：https：//gephi.org/plugins/＃/。
• Gephi Blog:https://gephi.wordpress.com/ ............

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